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雙鏈DNA上的脫堿基位點的損傷修復
脫堿基位點（abasic site）是最常見的一種DNA損傷。據估計，人體的每個細胞每天能產生5000到10000個脫堿基位點。沒有及時修復的脫堿基位點會阻礙RNA聚合酶的轉錄和DNA聚合酶的復制功能，從而可能導致進一步的突變，造成基因組的不穩定性，甚至癌癥的發生。 此前的研究主要針對雙鏈DNA上的脫堿基位點的損傷修復。最近，HMCES蛋白及其同源蛋白yedK被發現可以保護單鏈DNA上
南方科技大學
2021-04-14
發現細胞膜的DNA感受器促進腫瘤肝轉移
中性粒細胞是腫瘤微環境的重要組成部分，在腫瘤的遠處器官轉移中起著重要作用。既往多項研究發現，中性粒細胞在各種細胞因子、病原微生物或PMA、LPS等化合物刺激下，會將自身的核酸以及蛋白等物質釋放出來，形成以DNA為骨架，鑲嵌著彈性蛋白酶、髓過氧化物酶等顆粒蛋白的網狀樣結構，稱為中性粒細胞胞外捕獲網（Neutrophil Extracellular Traps, NETs）。最初的研究發現，NETs可以捕獲病原體，并通過局部高濃度的抗菌蛋白消滅病原體。近年來人們也發現，NETs里面的DNA成分即NET-DNA也參與了腫瘤的遠處轉移。但之前的研究更多的是集中在動物模型，NET-DNA在腫瘤患者遠處器官轉移的作用以及臨床意義仍不明確。此外，NET-DNA促進腫瘤轉移的機制也未得到詳細的闡述。 該課題組從臨床標本出發，發現NETs主要浸潤在乳腺癌、結腸癌患者的肝轉移組織，且血清NETs可以預測早期乳腺癌患者肝轉移的發生，提示在腫瘤發生肝轉移前，NETs可能浸潤于肝組織并促進腫瘤肝轉移的發生。 在機制方面，該課題組發現NET-DNA可以充當趨化腫瘤細胞運動的趨化因子，在不同小鼠模型中，發現肝臟或者肺組織中的NETs可吸引腫瘤細胞導致遠處轉移的發生。進一步研究發現，腫瘤細胞膜上存在NET-DNA受體CCDC25，CCDC25通過識別胞外的NET-DNA，激活ILK-β-parvin細胞骨架信號通路，增強腫瘤細胞的運動。既往研究認為DNA感受器主要位于胞內，該研究首次發現存在細胞膜上的DNA感受器。 尚未有研究深入探討CCDC25在腫瘤細胞中的作用，該蛋白是否可以成為治療靶點更是不為人知。該課題組通過多種模型進行驗證：1.在乳腺癌自發成瘤鼠（MMTV-PyMT）中敲除CCDC25； 2.乳腺癌細胞株以及原代乳腺癌細胞敲除CCDC25后接種于小鼠；3.在接種乳腺癌細胞株的小鼠腹腔注射中和抗體。實驗結果顯示：靶向CCDC25可以減少乳腺癌遠處器官轉移的發生。因此，該研究為乳腺癌患者遠處器官轉移提供新的靶點及治療策略。
中山大學
2021-04-13
早期胃腺癌原代細胞單鏈 DNA 適配子及制備方法
胃癌在世界范圍內和我國均是最常見的惡性腫瘤之一，根據世界 衛生組織公布的全球統計報告[1]，全球新發胃癌 98,9000 例，發病率 為 17.6/10 萬人，僅次于肺癌居第二位。早期胃癌是病灶局限于胃黏 膜和黏膜下層，不考慮是否有淋巴結轉移，因無明顯癥狀和局部體征， 常不足以引起患者和醫師的足夠重視而發生誤診或漏診。 目前，制備腫瘤細胞單鏈 DNA 適配子的方法主要涉及到隨機單 鏈 DNA 文庫和引物的構建、聚合酶
蘭州大學
2021-04-14
開發含硒DNA編碼化合物庫的合成方法
DNA編碼化合物庫的設計及篩選是當前新藥發現領域最前沿的技術之一，這種篩選是將目標靶點蛋白和整個DNA編碼化合物庫（億級）進行篩選。篩選體系中，數量巨大的化合物對同一靶標蛋白競爭性結合，而非傳統的單個化合物逐一篩選，因此這樣的篩選方式在速度和成本上具有顯著的優勢；其次，DNA編碼化合物庫具有非常大的庫容量（百萬到數百億數量級），可以涵蓋更為廣泛的化學空間，對于一些用傳統方法難以篩選的靶點，如蛋白-蛋白相互作用靶點，DEL技術已經顯示出巨大的潛力。目前DEL技術憑借其庫容量大、篩選速度快的特點，已成為化合物篩選的主流方法之一。當前，大型跨國制藥公司都已采用DNA編碼化合物庫技術進行藥物發現的研究。眾多基于該技術的新興生物科技公司/平臺涌現出來，如Ensemble therapeutics、X-Chem、DiCE Molecule、NuEvolution、Philochem、先導藥業、勁宇生物和藥明康德（DEL平臺）等。
硒是一種非金屬化學元素，位于化學元素周期表中位于第四周期VI A族（第34號元素）。硒在自然界的存在方式分為兩種：無機硒和植物活性硒。無機硒一般指亞硒酸鈉和硒酸鈉，從金屬礦藏的副產品中獲得；植物活性硒是由硒通過生物轉化與氨基酸結合而成，一般以硒蛋氨酸的形式存在。硒可用作光敏材料和電解錳行業催化劑，也是動物體必需的營養元素和植物有益的營養元素等。作為一種多功能的生命營養素，硒常常用于腫瘤癌癥克山病大骨節病、心血管病、糖尿病、肝病、前列腺病、心臟病、癌癥等40多種疾病，廣泛運用于癌癥、手術、放化療等。
上海科技大學
2021-04-11
一種DNA標記用熒光探針及其合成方法和用途
本發明公開了一種DNA標記用熒光探針及其合成方法和用途，該方法步驟為以乙醇為溶劑，加入摩爾比為1.05～2：1的N-(4-丁磺酸基)-4-甲基喹啉內鹽和3-甲酰基-6-(4-乙烯基吡啶)-9-乙基咔唑以及催化量的哌啶，加熱回流4-8小時；反應完畢，減壓蒸餾除去溶劑，用硅膠柱層析得到熒光探針。本發明的DNA標記用熒光探針與雙鏈DNA(ds26)有強烈的相互作用，在抗腫瘤藥物合成具有潛在的應用價值。本發明的DNA標記用熒光探針具有熒光背景低、與雙鏈DNA(ds26)結合特異性強、制備簡單和結構穩定等特點。
天津城建大學
2021-04-11
一種改進的海洋泥樣微生物總DNA提取方法
本技術方法提取的DNA質量 高，產率達0.4ug DNA/g濕土，適 合進一步純化以構建宏基因組文 庫。
中山大學
2021-04-10
揭示非典型尿嘧啶DNA糖基化酶UdgX的催化過程
通過解析蛋白脫底物及其與配體、DNA等一系列晶體結構（圖a-c），該研究揭示了MsmUdgX獨特的催化過程。研究發現，MsmUdgX首先對含U底物的 DNA發生尿嘧啶切除作用，然后其第109位的組氨酸與單鏈DNA底物AP位點的糖環形成一個共價鍵，因此可以耐受變性劑的作用；同時也由于酶無法再生，從而失去其固有的尿嘧啶酶切活性。該研究共解析了五套 MsmUdgX 的晶體結構，各自代表其催化途徑中不同階段酶所處的狀態，提出了如圖e所示的催化路徑模型，可能經歷一個稱為“oxacarbenium”的中間體。該機制不但合理解釋了MsmUdgX酶獨特的生化性質，而且發現酶在反應中通過一種“自殺”的方式抑制其自身活性，在已知的UDG酶中尚屬首例。此外，由于MsmUdgX只存在于細菌中，研究者的MsmUdgX-DNA共價復合物的結構可能為新型抗菌藥物的設計提供新思路，具有潛在的應用前景。
中山大學
2021-04-13
基于物聯網技術的草產品DNA條形碼溯源技術集成
黨的十八大提出“建設五位一體”的總布局，其中生態文明建設是基礎；我國正深入實施“一帶一路”戰略，推動互聯網與經濟社會各領域的深度融合。本項目在已經獲得自主知識產權的基礎上，整合蘭州大學在DNA條形碼和深圳市中光遠科技有限公司在物聯網智能系統方面的技術儲備，創制草產品DNA條形碼數據庫，構建草產品種植生產、檢驗、加工包裝和流通等溯源數據中心平臺，利用互聯網整合條形碼序列及生產加工信息構建草產品的溯源集成系統。迅速、快捷的追溯草品質及質量，提高草產品優質生產和消費安全，最終實現草產品從生產到銷售的全
蘭州大學
2021-04-14
一種保持種子活力的玉米單粒胚乳DNA的提取方法
本發明公開了屬于農業生物技術領域的玉米單粒胚乳DNA的提取方法。本發明先將種子浸泡，然后切去部分胚乳，再加入浸提緩沖液，在55℃水浴后將胚乳研磨；向胚乳中加入CTAB抽提液進行抽提，再加入蛋白酶K和醋酸鈉，最后加入飽和酚和氯仿/異戊醇，離心；向上清液中加入異丙醇，離心，用70％乙醇沖洗沉淀，干燥，加入TE中溶解。本發明方法不破壞種子本身的生活力，切除部分胚乳后仍可育苗移栽，利于進行大規模分子標記輔助選擇；其次，本發明方法提取的DNA濃度高、純度高；此外，本發明方法可在室內對育種后代進行分子標記輔助選擇，工作效率高，節約人力、物力和財力；最后，本發明被切割種子被感染發霉的概率低，育苗成功率高。
青島農業大學
2021-04-13
上海科技大學DNA編碼化合物庫技術（DEL）方法專利許可
該項目獲得2022年第五屆上海科技大學創新創業大賽生命學科賽場教師組三等獎；獲得2019年第二屆上海科技大學創新創業大會創新組三等獎。
上海科技大學
2023-03-16