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揭示轉錄因子Sox2調節體細胞重編程的新機制

2021-04-13 00:00:00
云上高博會 http://www.502d.xyz
關鍵詞: 轉錄因子Sox2
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所屬領域:
生物、醫藥及醫療機械
項目成果/簡介:

揭示了轉錄因子Sox2同時結合DNA和RNA并協同調控體細胞重編程的新機制,著重強調了在體細胞重編程過程中Sox2與RNA的直接相互作用的功能。

?通過PAR-CLIP和RNA SELEX確認了Sox2與RNA直接相互作用,進一步的測序分析發現Sox2偏好性結合一個CCCY核心基序和一個CGCG的二級基序。隨后,研究人員利用EMSA和RNA免疫沉淀(RNA-immunoprecipitation assay)等手段確定了Sox2的RNA結合結構域(RBM),該結構域具有優先結合富含GC的RNA序列的特征。另外,通過RNA fishing實驗和競爭性結合實驗等的進一步分析,發現在DNA和RNA共同存在的情況下,Sox2使用其HMG結構域結合同源DNA序列,并同時利用RBM結構域在體外介導三元RNA/Sox2/DNA復合物的形成。除此之外,通過比較Oct4、Klf4、c-Myc (OKM)“雞尾酒”以及不同Sox2突變體誘導下iPSC生成的效率發現,刪除Sox2 的RBM結構域會影響iPSC的生成,并且顯著地改變了體細胞重編程過程中的選擇性剪接事件。

       該研究加深了人們對Sox2蛋白調控多能性重編程機制的理解,進一步闡明了DRBPs對RNA代謝的調控機制。

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